Galvenā atšķirība starp šūnu proliferāciju un diferenciāciju ir tā, ka šūnu proliferācija ir šūnu skaita palielināšanas process, savukārt šūnu diferenciācija ir dažādu šūnu tipu veidošanās process, kam ir īpašas funkcijas.
Apaugļošana ir darbība, kas dzimumorgānu reprodukcijas laikā rada diploīdu zigotu no vīriešu dzimumšūnu saplūšanas ar sieviešu gametu. Šajā diploīdajā zigotā notiek dažādas izmaiņas, lai pārveidotos organismā. Šūnu proliferācija, šūnu diferenciācija un morfogenēze ir tādas izmaiņas, kas notiek embrija attīstības laikā. Šūnu skaits un masa palielinās daudzšūnu organismos, lai augtu un attīstītos. Turklāt nediferencētās cilmes šūnas diferencējas un pārveidojas par specifiskiem šūnu tipiem, kas organismā veic noteiktas funkcijas. Tādējādi pašreizējais raksts īsumā uzsver atšķirību starp šūnu proliferāciju un diferenciāciju.
