Galvenā atšķirība starp eksoskeletu un endoskeletu ir tā, ka eksoskelets ir ārējs skelets, kas atrodas ārpus dzīvnieka ķermeņa, savukārt endoskelets ir iekšējs skelets, kas atrodas dzīvnieka ķermenī.
Dzīvā organisma ķermenis, vai tas būtu medus bite vai cilvēks, ir dažādu orgānu sarežģīts tīkls. Šie orgāni veic vairākas savas funkcijas, turklāt ir savienoti viens ar otru, lai iegūtu harmonisku, līdzsvarotu un funkcionālu ķermeni. Visi ir sarežģīti dabas brīnumi, jo katrai sugai ir sava īpaša iezīme. Dažiem ir tikai endoskelets, savukārt dažiem ir tikai eksoskelets, bet dažiem ir abi, lai tos atbalstītu. Kā norāda nosaukums, eksoskelets atrodas ārpus ķermeņa, bet endoskelets - ķermeņa iekšienē. Ārējais skelets aizsargā un atbalsta arī dzīvnieka ķermeni. No otras puses, endoskelets sniedz atbalstu un aizsardzību gan iekšējiem mīkstākiem, gan trausliem orgāniem, piemēram, sirdij, plaušām un nierēm utt.
