Galvenā atšķirība starp auksīnu un citokinīnu ir tā, ka auksīns stimulē sakņu zarošanu, savukārt citokinīns inhibē sakņu zarošanu un sānu sakņu veidošanos. Lai tam pievienotu vairāk, auksīns galvenokārt ir atbildīgs par šūnu pagarināšanos stublājā un sakņu galos, turpretī citokinīni galvenokārt ir atbildīgi par šūnu dalīšanos, un tāpēc tie ir sastopami augošajos apgabalos.
Fitohormoni, kas pazīstami arī kā augu hormoni, ir svarīgas ķīmiskas vielas augu augšanai un attīstībai. Tās ir organiskas molekulas, un tās darbojas kā signālmolekulas, kas regulē augu attīstību. Ir pieci galvenie augu hormonu veidi: auksīns, gibberelīns, citokinīns, etilēns un abscīnskābe. Tādējādi viņi atsevišķi un kopā veic dažādas funkcijas, lai ietekmētu augu augšanu.