Galvenā atšķirība - I tipa un II tipa ierobežojošais enzīms
Ierobežojošajam enzīmam, ko biežāk dēvē par restrikcijas endonukleāzi, ir spēja sašķelt DNS molekulas mazos fragmentos. Šis šķelšanās process notiek netālu vai īpašā DNS molekulas atpazīšanas vietā, ko sauc par restrikcijas vietu. Atpazīšanas vietne parasti sastāv no 4-8 bāzes pāriem. Atkarībā no šķelšanās vietas restrikcijas enzīmi var būt četri dažādi; I, II, III un IV tips. Atdalot restrikcijas enzīmus četrās grupās, papildus šķelšanās vietai tiek ņemti vērā tādi faktori kā sastāvs, prasība pēc kopfaktoriem un mērķa secības stāvoklis. DNS molekulas šķelšanās laikā šķelšanās vieta var būt vai nu pašā restrikcijas vietā, vai arī attālumā no restrikcijas vietas. DNS šķelšanas procesārestrikcijas fermenti veido divus iegriezumus caur katru cukura fosfāta mugurkaulu DNS dubultā spirālē. Ierobežojošie enzīmi galvenokārt ir atrodami ahajā un baktērijās. Viņi izmanto šos enzīmus kā aizsardzības mehānismu pret iebrucējiem vīrusiem. Ierobežojošie fermenti sašķeļ svešo (patogēno) DNS, bet ne savu DNS. Tās pašas DNS aizsargā ferments, kas pazīstams kā metiltransferāze, kas veic izmaiņas saimniekdatora DNS un novērš šķelšanos. I tipa restrikcijas fermentam ir šķelšanās vieta, kas atrodas prom no atpazīšanas vietas. II tipa ierobežojošie enzīmi sadalās pašā atpazīšanas vietā vai tuvāk tai. Šī ir galvenā atšķirība starp I un II tipa restrikcijas enzīmiem. Ierobežojošie enzīmi galvenokārt ir atrodami ahajā un baktērijās. Viņi izmanto šos enzīmus kā aizsardzības mehānismu pret iebrucējiem vīrusiem. Ierobežojošie fermenti sašķeļ svešo (patogēno) DNS, bet ne savu DNS. Tās pašas DNS aizsargā ferments, kas pazīstams kā metiltransferāze, kas veic izmaiņas saimniekdatora DNS un novērš šķelšanos. I tipa restrikcijas fermentam ir šķelšanās vieta, kas atrodas prom no atpazīšanas vietas. II tipa ierobežojošie enzīmi sadalās pašā atpazīšanas vietā vai tuvāk tai. Šī ir galvenā atšķirība starp I un II tipa restrikcijas enzīmiem. Ierobežojošie enzīmi galvenokārt ir atrodami ahajā un baktērijās. Viņi šos fermentus izmanto kā aizsardzības mehānismu pret iebrucējiem vīrusiem. Ierobežojošie fermenti sašķeļ svešo (patogēno) DNS, bet ne savu DNS. Tās pašas DNS aizsargā ferments, kas pazīstams kā metiltransferāze, kas veic izmaiņas saimniekdatora DNS un novērš šķelšanos. I tipa restrikcijas fermentam ir šķelšanās vieta, kas atrodas prom no atpazīšanas vietas. II tipa ierobežojošie enzīmi sadalās pašā atpazīšanas vietā vai tuvāk tai. Šī ir galvenā atšķirība starp I un II tipa restrikcijas enzīmiem. Tās pašas DNS aizsargā ferments, kas pazīstams kā metiltransferāze, kas veic izmaiņas saimniekdatora DNS un novērš šķelšanos. I tipa restrikcijas fermentam ir šķelšanās vieta, kas atrodas prom no atpazīšanas vietas. II tipa ierobežojošie enzīmi sadalās pašā atpazīšanas vietā vai tuvāk tai. Šī ir galvenā atšķirība starp I un II tipa restrikcijas enzīmiem. Tās pašas DNS aizsargā ferments, kas pazīstams kā metiltransferāze, kas veic izmaiņas saimniekdatora DNS un novērš šķelšanos. I tipa restrikcijas fermentam ir šķelšanās vieta, kas atrodas prom no atpazīšanas vietas. II tipa ierobežojošie enzīmi sadalās pašā atpazīšanas vietā vai tuvāk tai. Šī ir galvenā atšķirība starp I un II tipa restrikcijas enzīmiem.
SATURS
1. Pārskats un galvenās atšķirības
2. Kas ir I tipa ierobežojošais enzīms
3. Kas ir II tipa ierobežojošais enzīms
4. Līdzības starp I un II tipa ierobežojošo enzīmu
5. Blakus salīdzinājums - I tipa vs II tipa ierobežojošais enzīms tabulas veidā
6. Kopsavilkums
Kas ir I tipa ierobežojošais enzīms?
I tipa restrikcijas fermenti ir pentamēra proteīni, kas sastāv no trim daudzām apakšvienībām: restrikcijas apakšvienības, metilēšanas apakšvienības un DNS sekvences atpazīšanas apakšvienības. Šīs apakšvienības nav identiskas. Sākotnēji tie tika identificēti divās dažādās Escherichia coli formās. Šo restrikcijas enzīmu šķelšanās vieta atrodas dažādos nejaušos punktos, parasti 1000 bāzes pāru attālumā no atpazīšanas vietas. Šiem restrikcijas enzīmiem nepieciešams ATP, Mg 2+un S-adenozil-L-metionīnu tā aktivizēšanai. I tipa restrikcijas fermentiem piemīt gan metilāzes, gan restrikcijas aktivitātes. Baktērijas izmanto ierobežojošos enzīmus kā šūnu aizsardzības mehānismu no iebrucējiem vīrusiem. Ierobežojošie fermenti sašķeļ vīrusa DNS un tos iznīcina. Bet, lai novērstu paša saimnieka DNS šķelšanos, I tipa restrikcijas ferments nodrošina metilēšanas aizsardzību. Tas modificē saimnieka DNS un novērš šķelšanos. Lai arī šie restrikcijas fermenti ir bioķīmiski svarīgi, tos neizmanto plaši, jo tie nenodrošina atsevišķus restrikcijas fragmentus vai saistīšanās ar gēlu modeli.
Kas ir II tipa ierobežojošie fermenti?
II tipa restrikcijas enzīmi savā struktūrā satur divas identiskas apakšvienības. Homodimērus veido II tipa restrikcijas fermenti ar atpazīšanas vietām. Atpazīšanas vietas parasti ir palindromiskas un nedalītas. Tā garums ir 4-8 bāzes pāri. Atšķirībā no I tipa, II tipa ierobežojošā enzīma šķelšanās vieta atrodas atpazīšanas vietā vai atrodas tuvu atpazīšanas vietai.
02. attēls: II tipa ierobežojošie fermenti
Šie restrikcijas fermenti ir bioķīmiski nozīmīgi un ir plaši pieejami komerciāli. Lai to aktivizētu, tas prasa tikai Mg 2+. Tam nav metilēšanas aktivitātes, un tā nodrošina tikai ierobežošanas aktivitāti. Šie restrikcijas fermenti saistās ar DNS molekulām kā homodimēri un spēj atpazīt simetriskas DNS, kā arī asimetriskas sekvences.
Kādas ir I un II tipa ierobežojošo enzīmu līdzības?
- I un II tipa restrikcijas fermenti ir fermentu veidi, kas ir restrikcijas endonukleāzes, kas saistītas ar DNS molekulu šķelšanos mazākos fragmentos.
- Abi ir noderīgi molekulāri bioloģiskajās metodēs.
Kāda ir atšķirība starp I un II tipa ierobežojošajiem fermentiem?
Atšķirīgs raksts vidū pirms tabulas
I tipa vs II tipa ierobežojošais enzīms |
|
| I tipa restrikcijas ferments ir DNS restrikcijas ferments, kas sašķeļ DNS nejaušās vietās tālu no tā atpazīšanas vietas. | II tipa restrikcijas ferments ir DNS restrikcijas ferments, kas sašķeļ DNS noteiktās vietās tuvu atzīšanas vietai vai tās tuvumā. |
| Sastāvs | |
| I tipa restrikcijas ferments ir komplekss ferments, kas sastāv no trim (03) nenidentiskām apakšvienībām. | II tipa restrikcijas ferments ir vienkāršs ferments, kas sastāv no divām identiskām apakšvienībām. |
| Molekulārais svars | |
| I tipa ierobežojošais ferments sver 400 000 daltonu. | II tipa ierobežojošā enzīma svara diapazons ir 20 000 - 100 000 daltonu. |
| Šķelšanās secība | |
| I tipa restrikcijas fermentā šķelšanās secība nav specifiska. | II tipa restrikcijas fermentam ir noteikta šķelšanās secība. |
| Sadalīšanas vieta | |
| Sadalīšanās vieta ir 1000 nukleotīdu attālumā no atpazīšanas vietas I tipa restrikcijas enzīmos. | Sadalīšanas vieta atrodas atpazīšanas vietā vai nelielā attālumā no atpazīšanas vietas II tipa restrikcijas fermentā. |
| Kofaktori aktivizēšanai | |
| I tipa restrikcijas enzīmam tā aktivizēšanai nepieciešams ATP, Mg 2+ un S-adenozil-L-metionīns. | II tipa restrikcijas enzīma aktivizēšanai ir nepieciešams tikai Mg2 +. |
| Metilēšanas aktivitāte | |
| I tipa ferments nodrošina DNS aizsardzību metilēšanas ceļā. | II tipa restrikcijas enzīmos nav metilēšanas aktivitātes. |
| Fermenta darbība | |
| I tipa restrikcijas ferments nodrošina gan endonukleāzes (restrikcijas), gan metilēšanas aktivitātes. | II tipa ierobežojošais ferments nodrošina tikai ierobežojošu aktivitāti. |
| Piemēri | |
| EcoK, EcoB | Hind II, EcoRI |
Kopsavilkums - I tipa un II tipa ierobežojošais enzīms
Ierobežojošos enzīmus sauc par bioloģiskām šķērēm, kas DNS molekulas sašķeļ mazākās vielās. Ierobežojošie enzīmi tiek diferencēti 04 dažādās kategorijās atbilstoši šķelšanās vietas atrašanās vietai attiecībā uz atpazīšanas vietu, esošajiem kopfaktoriem, mērķa secības sastāvu un stāvokli. Tā aktivizēšanai, Type I restrikcijas fermenti pieprasīt ATP, Mg 2+, un S-adenozil-L-metionīns. I tipa restrikcijas enzīma šķelšanās vieta parasti atrodas 1000 bāzes pāru attālumā no atpazīšanas vietas un nodrošina DNS metilāzes aizsardzību. II tipa ierobežojumu fermentiem nepieciešams tikai Mg 2+tā aktivizēšanai. Sadalīšanas vieta atrodas atpazīšanas vietā vai tās tuvumā. Tam nav metilēšanas aktivitātes, un tas ir plaši pieejams komerciāli. Šī ir atšķirība starp I tipa restrikcijas enzīmu un II tipa restrikcijas enzīmu.
Lejupielādēt I tipa un II tipa ierobežošanas enzīma PDF versiju
Jūs varat lejupielādēt šī raksta PDF versiju un izmantot to bezsaistes vajadzībām, kā norādīts piezīmē. Lūdzu, lejupielādējiet šeit PDF versiju. Starpība starp I un II tipa ierobežojošajiem fermentiem.
