Galvenā atšķirība - YAC pret BAC vektoriem
Vektorus izmanto molekulārajā klonēšanā. Vektoru var definēt kā DNS molekulu, kas uzvedas kā nesējs, lai svešu ģenētisko materiālu nogādātu citā šūnā. Vektors, kas satur svešu DNS, ir pazīstams kā rekombinantā DNS, un tam vajadzētu būt iespējai to atkārtot un ekspresēt saimniekorganismā. Rauga mākslīgā hromosoma (YAC) un baktēriju mākslīgā hromosoma (BAC) ir divu veidu vektori, kas iesaistīti klonēšanā. Galvenā atšķirība starp YAC un BAC ir tā, ka YAC ir mākslīgi izveidota vektoru sistēma, kurā tiek izmantots īpašs rauga hromosomas reģions, lai rauga šūnās ievietotu lielus ģenētisko materiālu segmentus, savukārt BAC ir mākslīgi izveidota vektoru sistēma, izmantojot noteiktu E. coli hromosomas reģionu. ievietot lielus DNS segmentus E. coli šūnās.
SATURS
1. Pārskats un galvenās atšķirības
2. Kas ir YAC vektori
3. Kas ir BAC vektori
4. Blakus salīdzinājums - YAC vs BAC vektori
5. Kopsavilkums
Kas ir YAC vektori?
YAC (rauga mākslīgā hromosoma) ir mākslīgi veidota hromosoma, kas spēj pārvadāt lielu daudzumu svešas DNS un atkārtoties rauga šūnās. Tam ir centromēra, telomēri, kā arī autonomi replikējošas sekvences, kas ir būtiskas replikācijai un stabilitātei. YAC vajadzētu būt arī ar selektīvu marķieri vai marķieriem un restrikcijas vietām, lai padarītu to par efektīvu klonēšanas vektoru. Lielu secību diapazonā no 1000 kb līdz 2000 kb var ievietot YAC un pārnest uz raugu. YAC transformācijas efektivitāte ir ļoti zema.
01. attēls: YAC vektors
Kas ir BAC vektori?
Baktēriju mākslīgā hromosoma (BAC) ir mākslīgi izveidota hromosoma molekulārai klonēšanai. Tam ir specifiski E. coli F plazmīda reģioni, un tas ir apļveida un ļoti savīti. BAC ir izstrādāts, lai klonētu DNS fragmentus baktērijām, īpaši E. coli. Tas var saturēt DNS fragmentus ar izmēru līdz 300 kb. Salīdzinot ar YAC, BAC klonēšanas ieliktņi ir mazāki pēc izmēra. BAC tika izstrādāti 1992. gadā, un tā joprojām ir populāra tās stabilitātes un vieglās konstrukcijas dēļ. BAC ir noderīgi arī vakcīnu izstrādē.
02. attēls: BAC vektors molekulārajā klonēšanā
Kāda ir atšķirība starp YAC un BAC vektoriem?
Atšķirīgs raksts vidū pirms tabulas
YAC pret BAC vektoriem |
|
| YAC ir ģenētiski modificēta hromosoma, kuras klonēšanai izmanto rauga DNS. | BAC ir ģenētiski modificēta DNS molekula, kurā klonēšanai izmanto E. coli DNS. |
| Dzimums | |
| YAC tika izstrādāti, lai klonētu lielus genoma DNS fragmentus raugā. | BAC tika izstrādāti lielu genomu fragmentu klonēšanai Escherichia coli. |
| Ievietot garumu | |
| YAC var saturēt megabāzes lieluma genoma ieliktņus. (1000 kb - 2000 kb). | BAC var ievietot ieliktņus 200–300 kb vai mazāk. |
| Celtniecība | |
| YAC DNS ir grūti attīrīt neskartu, un, lai izveidotu YAC vektoru sistēmu, nepieciešama augsta koncentrācija. | BAC ir viegli tīrāms neskarts un viegli konstruējams. |
| Kimērisms | |
| YAC bieži ir himēriski. | BAC reti ir himēriski. |
| Stabilitāte | |
| YAC ir nestabils. | BAC ir stabils. |
| Modifikācijas | |
| Rauga rekombinācija ir ļoti iespējama un vienmēr paliek aktīva. Tādējādi tas var ģenerēt dzēšanu un citus pārkārtojumus YAC. | E. coli rekombinācija tiek novērsta un pēc nepieciešamības tiek ieslēgta. Tādējādi tas samazina nevēlamus BAC pārkārtojumus. |
| Apkope | |
| Manipulējot ar rekombinantiem YAC, parasti ir nepieciešams, lai YAC tiktu pārnests uz E. coli turpmākajām manipulācijām. Tādējādi tas ir darbietilpīgs process. | BAC modifikācija notiek tieši E. coli. Tātad DNS nodošana nav nepieciešama. Tādējādi process nav darbietilpīgs. |
Kopsavilkums - YAC pret BAC vektoriem
YAC ir kļuvis par būtisku pētījumu instrumentu klonēšanas procesos, pateicoties spējai klonēt lielus DNS fragmentus saimniekorganismā. Tomēr YAC ir vairāki trūkumi kā vektoriem, piemēram, konstrukcijas grūtības, himerisms, nestabilitāte utt. Tāpēc, lai pārvarētu šīs problēmas, zinātnieki ir izstrādājuši BAC vektorus. BAC ir konstruēts, izmantojot specifiskus E. coli hromosomas reģionus. Tas ir stabils vektors, un to var viegli konstruēt. Tomēr DNS garums, ar kuru BAC var rīkoties, ir līdz pat 20 reizēm mazāks nekā YAC. Tā ir atšķirība starp YAC un BAC vektoru sistēmām. Mūsdienās laboratorijās priekšroka tiek dota BAC, nevis YAC.
