Galvenā atšķirība - genotipēšana pret secību
Genotipēšana un sekvencēšana ir divas metodes, kas tiek veiktas, lai iegūtu informāciju par nukleīnskābēm, galvenokārt organisma DNS. Galvenā atšķirība starp genotipēšanu un sekvencēšanu ir tā, ka genotipizēšana ir process, ar kuru, izmantojot marķierus, tiek noteikts, kurš ģenētiskais variants ir indivīdam, savukārt sekvencēšana ir pareizas nukleotīdu secības secības noteikšana attiecīgajā DNS fragmentā.
SATURS
1. Pārskats un galvenās atšķirības
2. Kas ir genotipēšana
3. Kas ir secība
4. Blakus salīdzinājums - genotipēšana vs secība
5. Kopsavilkums
Kas ir genotipēšana?
Genotipēšana ir indivīda ģenētiskā uzbūves noteikšana, izmantojot DNS un marķieru secību, kā arī tās mantojuma salīdzināšana un identificēšana. Genotipēšana ir svarīga evolūcijas bioloģijā, populācijas bioloģijā, taksonomijā, ekoloģijā un organismu ģenētikā. To var veikt ar dažādām metodēm, ieskaitot DNS sekvencēšanu, polimerāzes ķēdes reakciju, restrikcijas fragmenta garuma polimorfismu (RFLP), nejaušinātu amplificētu polimorfu noteikšanu, amplificētu fragmentu garuma polimorfismu (AFLP), DNS mikrošuves utt.
Genotipēšana ietver noteiktu nelielu DNS sekvences fragmentu sekvencēšanu un ģenētiskā sastāva saistības ar citiem indivīdiem noteikšanu, izmantojot ģenētiskos marķierus. Tas nosaka atsevišķu nukleotīdu polimorfismus (SNP) starp indivīdiem vai specifiskajām alēlēm. Genotipa noteikšana ir piemērojama daudziem organismiem, ieskaitot cilvēkus. Tas ir piemērojams arī tādiem mikroorganismiem kā vīrusi, sēnītes utt., Un to var izmantot, lai noteiktu to ģenētiskos variantus ar atsauces profiliem. Molekulārajā epidemioloģijā un kriminālistikas mikrobioloģijā patogēnu, jo īpaši mikroorganismu, kontroli veic ar informāciju, kas iegūta, genotipējot. Genotipizēšana ir ļoti svarīga ciltsrakstu analīzē. Cilvēki tiek genotipēti, lai apstiprinātu māti un tēvu. Genotips atklās dominējošās un recesīvās gēnu alēles, kas izlemj specifiskas iezīmes.
Attēls_1: RFLP genotipēšana
Kas ir secība?
Secība ir process, kurā nosaka pareizu nukleotīda secību noteiktā DNS vai RNS fragmentā. Praktiski visa informācija, kas nepieciešama organisma augšanai un attīstībai, ir iekodēta tā genomā. Dažu simtu nukleotīdu garu nukleīnskābju fragmentu iegūšanas un atdalīšanas paņēmienu pieejamība ļāva izstrādāt procedūras, lai noteiktu precīzu konkrētā DNS vai RNS fragmenta nukleotīdu secību. Mūsdienās ir pieejami dažādi sekvencēšanas metožu veidi. Šīs sekvencēšanas metodes kopā ar visu organisma genomu pārstāvošo genoma bibliotēku izveidošanas tehnoloģijām atvieglo visa organisma genoma sekvencēšanu, veicot gēnu struktūru, gēnu funkciju, gēnu lokalizācijas, gēnu izpausmju padziļinātu analīzi, gēnu kartēšana, gēnu regulēšanas reģioni utt.
Daudzu vīrusu, vairāku baktēriju, arheebaktēriju, rauga un vairāku citu organismu kopējie genomi ir secīgi izveidoti un kartēti. Cilvēka genoma projekts ļāva secināt un kartēt visu cilvēka genomu un publicēt tā pirmo melnrakstu 2003. gadā. Tas ir nozīmīgs pagrieziena punkts bioloģijas attīstībā. Cilvēka genoma sekvences tagad tiek izmantotas medicīnas nozarē, lai noteiktu retu slimību ģenētiskos cēloņus, pārbaudītu jaundzimušo slimību risku, noteiktu dažādu vēža ģenētiskās detaļas, izstrādātu jaunus terapijas līdzekļus un izstrādātu jaunus diagnostikas rīkus utt.
Augu pasaulē ir sekvencēti rīsu genomi un Arabidopsis genomi. Zināšanas par šīm sekvencēm neapšaubāmi radīs pārmaiņas mūsu izpratnē par šūnu un organismu darbību.
Attēls_2: dziedātāju sekvencēšanas autoradiogrāfs
Kāda ir atšķirība starp genotipēšanu un secību?
Atšķirīgs raksts vidū pirms tabulas
Genotipēšana vs secība |
|
| Genotipizēšana ir indivīda ģenētiskā sastāva noteikšanas un šī organisma grupas vai taksonomijas pārbaudes process. | Secība ir process, ar kuru nosaka precīzu DNS vai RNS fragmenta nukleotīdu secību. |
| Tehnika | |
| RFLP, gēnu sekvencēšana, PCR, DNS mikroelementi, AFLP utt. | Sanger sekvencēšana, Gilbert sekvencēšana, Pyrosequencing, nākamās paaudzes sekvencēšana, Shotgun secība utt. |
| Galvenās rūpes | |
| Tas ir vairāk noraizējies par to, vai genotipa atšķirības dod faktiskās fenotipa atšķirības. | Tas vairāk uztrauc nukleotīdu kārtību un tā atšķirības un izmaiņas ar citiem organismiem. |
Kopsavilkums - genotipēšana vs secība
Genotipizēšana un sekvencēšana ir noderīga organismu ģenētiskās informācijas izpētei. Genotipēšana ir process, kurā nosaka indivīdu genotipa variācijas un atrod viņu kategorijas. Secība ir process, kurā nosaka pareizo nukleotīdu secību interesētajā fragmentā vai DNS reģionā. Abas metodes sniedz svarīgu informāciju par gēniem un genomiem.
