Galvenā atšķirība starp platohinonu un plastocianīnu ir tā, ka plastohinons ir lipofila nesējmolekula, kas elektronus pārnes uz plastocianīnu caur citohroma b6f olbaltumvielu kompleksu. Bet plastocianīns ir mazs ūdenī šķīstošs zilā vara proteīns, kas pieņem elektronu pāri no citohroma b 6 f kompleksa un nodod to I fotosistēmai tilakoīdu telpā.
Fotosintēzei ir divu veidu reakcijas kā no gaismas atkarīgas reakcijas un no gaismas neatkarīgas reakcijas. Šie divi fotosistēmu veidi spēlē svarīgu lomu no gaismas atkarīgās reakcijās. Tās ir I un II fotosistēma. Fotosistēmas ir lieli olbaltumvielu un pigmentu vai gaismu absorbējošu molekulu kompleksi. Viņi uztver enerģiju no saules gaismas. P700 ir I fotosistēmas reakcijas centrs, bet P680 II fotosistēmas reakcijas centrs. Katra fotosistēma absorbē gaismu un fotofosforilējot rada ATP. Viņi arī ražo NADPH. No gaismas atkarīgās reakcijās piedalās vairāki elektronu akceptoru veidi. Plastohinons un plastocianīns ir divu veidu molekulas, kas iesaistītas elektronu transporta ķēdē.
