Galvenā atšķirība starp AMPA un NMDA receptoriem ir tā, ka AMPA receptoru specifiskais agonists ir alfa-amino-3-hidroksil-5-metil-4-izoksazola propionskābe (AMPA), savukārt NMDA receptoru specifiskais agonists ir N-metil - D - aspartāts (NMDA).
Ir trīs galvenie glutamāta receptoru veidi. To atšķirība ir balstīta uz agonistu, kas saistās ar saistīšanās ar glutamātu receptora aktivizēšanu. Saistoties ar glutamātu, tiks atvērti jonu vārti kanāli nātrija un kālija jonu transportēšanai. Arī NMDA receptori atvieglo kalcija jonu plūsmu visā membrānā.
