Galvenā atšķirība starp iekļūšanu un izslēgšanu balstās uz metodi, ko izmanto, lai izveidotu transgēnu organismu. Iekļaujot gēnu, notiek jauna gēna ievietošana, savukārt gēna nokautā notiek esoša gēna noņemšana, lai izveidotu transgēnu organismu.
Transgēnie organismi ir organismi ar mainītu ģenētisko sastāvu. “Rekombinantie organismi” ir to sinonīms. Vairumā gadījumu transgēniem organismiem ir labvēlīgas īpašības. Veidojot transgēnus organismus, gēni kļūst par mērķi. Saskaņā ar nepieciešamību gēnu var ieviest vai noņemt. Gēnu klauvēšana attiecas uz jauna gēna ieviešanu, savukārt gēna izslēgšana attiecas uz gēna noņemšanu.