Galvenā atšķirība starp hibrīdajām un deģenerētajām orbitālēm ir tā, ka hibrīdās orbitāles ir jaunas orbitāles, kas veidojas, sajaucot divas vai vairākas orbitāles, turpretī deģenerētās orbitāles sākotnēji pastāv atomā.
Kā norāda nosaukums, hibrīdā orbitāle ir divu vai vairāku orbitāļu hibrīds. Lai arī deģenerētās orbitāles nosaukums šķiet vienāds, tās nav jaunizveidotas orbitāles - tās jau pastāv atomā. Turklāt visām hibrīda orbitālēm molekulā ir vienāda enerģija, bet deģenerētajām orbitālēm atomā ir tāda pati enerģija.
