Galvenā atšķirība starp autonomām un paratoniskām kustībām ir tā, ka autonomās kustības ir atbildes uz stimulu, kas augu iekšienē radies gēnu dēļ, savukārt paratoniskās kustības ir augu atbildes uz ārēju stimulu, neiesaistot gēnus.
Augi reaģē uz ārējiem stimuliem; tie reaģē arī uz augu radītajiem stimuliem. Pamatojoties uz to, ir divu veidu kustības kā autonomas kustības un paratoniskas kustības. Autonomās kustības ir atbildes reakcija uz dažiem iekšējiem cēloņiem, jo īpaši gēnu iesaistīšanās dēļ. Turpretī paratoniskās kustības ir atbildes reakcija uz ārējiem stimuliem, piemēram, siltumu, spiedienu, ūdeni, saules gaismu utt. Sakarā ar gēnu iesaistīšanos autonomās kustības augos ir dzimšanas brīdī, atšķirībā no paratoniskām kustībām.
