Galvenā atšķirība starp prokariotu un eikariotu ribosomām ir tā, ka prokariotu ribosomas ir 70S daļiņas, kas sastāv no 50S lielas apakšvienības un 30S mazas apakšvienības, savukārt eikariotu ribosomas ir 80S daļiņas, kas sastāv no 60S lielas apakšvienības un 40S mazas apakšvienības.
Prokarioti un eikarioti ir divas galvenās dzīvo organismu grupas, kas atšķiras no šūnu organizācijas. Prokariotiem nav kodola un ar membrānu saistītu šūnu organellu. No otras puses, eikariotiem piemīt kodols un ar membrānu saistītas šūnu organellas. Ir daži organoīdi, kas kopīgi abiem organismiem. Ribosoma ir viens no svarīgiem un vitāli svarīgiem organoīdiem, kas atrodas gan prokariotu, gan eikariotu šūnās. Tie atrodas katras šūnas citoplazmā. Strukturāli olbaltumvielas un ribosomālā RNS (rRNS) kopā veido ribosomas. Un tie sastāv no divām apakšvienībām, proti, lielākas apakšvienības un mazas apakšvienības. Viņi arī veic to pašu funkciju, kas ir mRNS molekulu tulkošana olbaltumvielās. Tā kā tulkošana ir būtisks process visiem dzīvajiem organismiem un tas notiek ribosomās,ribosomas ir ļoti svarīgas gan prokariotiem, gan eikariotiem. Neskatoties uz daudzām līdzībām, starp prokariotu un eikariotu ribosomām ir dažas atšķirības.