Galvenā atšķirība starp borazīnu un benzolu ir tā, ka borazīns gredzena struktūrā satur trīs bora atomus un trīs slāpekļa atomus, turpretī benzols gredzena struktūrā satur sešus oglekļa atomus.
Gan borazīnam, gan benzolam ir līdzīga struktūra ar sešu locekļu gredzenu, un šie divi savienojumi ir izoelektroniski. Tas nozīmē, ka gan borazīnam, gan benzolam ir vienāds elektronu skaits vai vienāda elektroniskā struktūra. Tomēr tām ir pilnīgi atšķirīgas ķīmiskās un fizikālās īpašības, jo šo savienojumu gredzeni sastāv no dažādiem atomiem.