Galvenā atšķirība starp ģeogrāfisko un reproduktīvo izolāciju ir tāda, ka ģeogrāfiskā izolācija ir reproduktīvās izolācijas kategorija, kas attiecas uz organismu populāciju atdalīšanu no pārošanās vai ģenētiskā materiāla apmaiņas ar fiziskām robežām, savukārt reproduktīvā izolācija attiecas uz mehānismu kopumu, kas novērš sugu klātbūtni. no pārošanās un auglīgu pēcnācēju radīšanas.
Apaugļošana ir spermas un olšūnas savienojums, veidojot diploīdu zigotu dzimum reprodukcijas laikā. Ja saražotā zigota ir nobriedusi, tā galu galā pāraugs veselīgā auglīgā pēcnācējā. tāpēc reproduktīvā izolācija ir process, kas novērš auglīgu pēcnācēju veidošanos. Šī profilakse var notikt apaugļošanas procesā vai pēc apaugļošanas. Jebkurā gadījumā galu galā tas rada šķērsli auglīgu pēcnācēju radīšanai, kas var dzemdēt vēl vienu auglīgu pēcnācēju. Starp dažādiem mehānismiem ģeogrāfiskā izolācija ir reproduktīvās izolācijas faktors.