Galvenā atšķirība starp DNS un RNS nukleotīdu ir tā, ka DNS nukleotīds vai dezoksiribonukleotīds satur dezoksiribozes cukuru, savukārt RNS nukleotīds vai ribonukleotīds satur ribozes cukuru.
Nukleotīdi ir nukleīnskābju pamata vienība. Tie ir DNS un RNS celtniecības bloki vai monomēri. Viņi savstarpēji savienojas, veidojot polinukleotīdu ķēdi, kas piešķir struktūru DNS vai RNS. Nukleotīdā ir trīs galvenie komponenti. Tie ir slāpekļa bāze, pentozes cukurs (pieci oglekļa cukurs) un fosfātu grupas. Ir piecas dažādas slāpekļa bāzes, piemēram, Adenīns, Timīns, Citozīns, Guanīns un Uracils. Timīns ir redzams tikai DNS, savukārt uracils ir raksturīgs tikai RNS. Nukleīnskābēs ir divu veidu pieci oglekļa cukuri. RNS satur ribozes cukuru, bet DNS satur dezoksiribozes cukuru. Nukleotīdi satur trīs fosfātu grupas, kas piestiprinātas pie pentozes cukura.
