Galvenā atšķirība starp homozigotu un heterozigotu ir tā, ka homozigoti nozīmē, ka abas alēles ir līdzīgas pazīmei, bet heterozigotas nozīmē, ka abas alēles ir atšķirīgas īpašībai.
No vecāku hromosomām mantotie gēni kontrolē visas dzīvnieku, augu un visu citu dzīvo būtņu rakstzīmes vai iezīmes. Tas ir galvenais iemesls vecāku īpašību parādīšanai pēcnācējiem. Lielākajai daļai eikariotu organismu ir divi gēnu komplekti, kas pazīstami kā mātes un tēva gēni. Tāpēc ģenētiskā situācija ir pazīstama kā diploīds (divi hromosomu komplekti). Tas nozīmē; visām īpašībām ir gan mātes, gan tēva ģenētiskie komponenti. Tomēr šie gēni varētu būt vai nu dominējoši, vai recesīvi viens otram, un tieši šeit kļūst nozīmīgas homozigotas un heterozigotas īpašības. Homozigots ir stāvoklis ar divām dominējošām alēlēm (AA) vai divām recesīvām alēlēm (aa), bet heterozigots ir stāvoklis, kad ir viena dominējošā alēle un viena recesīvā alēle (Aa).
