Galvenā atšķirība starp homozigotu un hemizigotu ir tā, ka homozigots ir stāvoklis, kad abas diploīda organisma alēles ir vienādas, bet hemizigota ir stāvoklis, kurā atrodas tikai viena alēle.
Gēni pastāv kā alēles vai kopijas. Parasti gēnam ir divas alēles. Alele ir gēna versija, kuras rezultāts ir atšķirīgs fenotipiskais efekts. Alēles var būt dominējošas vai recesīvas. Dominējošās alēles ir pilnībā izteiktas fenotipā, savukārt recesīvās alēles fenotipu neuzrāda, ja tās atrodas ar dominējošām alēlēm. Homozigoti, heterozigoti, hemizigoti un nullizigoti ir atšķirīgi zigozitātes līmeņi. Homozigots ir stāvoklis, kad ir līdzīgas alēles - vai nu divas dominējošās, vai divas recesīvās alēles. Hemizigots ir stāvoklis, kad ir tikai viena gēna kopija vai alēle.
