Galvenā atšķirība starp GFP un EGFP ir tā, ka GFP ir savvaļas tipa olbaltumviela, kas iekļauta ne-zīdītāju šūnu molekulārajā klonēšanā, savukārt EGFP ir uzlabots vai izveidots GFP veids, ko var izmantot zīdītāju šūnās.
Molekulārā klonēšana ir progresīva metode, kuru zinātnieki ārkārtīgi izmanto, izsakot olbaltumvielas, izmantojot rekombinanto tehnoloģiju. Rekombinantā DNS tehnoloģijā ir nepieciešams veiksmīgi pārveidot rekombinanto vektoru, lai uzņemtu organismu. Tādējādi transformācijas procesā būtu jāidentificē un jāapstiprina, vai interesējošais gēns ir pārveidots saimniekam. Lai to novērtētu, molekulārie biologi izmanto vairākas metodes. No šīm metodēm viens ir reportiera gēns. Šie reportiera gēni darbojas kā atlasāmi marķieri, lai izvēlētos pareizos transformantus. Tādējādi zaļais fluorescējošais proteīns (GFP) un uzlabotais zaļais fluorescējošais proteīns (EGFP) ir divi reportieru proteīni, ko izmanto molekulārajā klonēšanā.
