Galvenā atšķirība starp pepsīnu un renīnu ir tā, ka pepsīns, kas ir viens no galvenajiem gremošanas enzīmiem, ir proteāze, ko izdala kuņģis, savukārt renīns ir ferments un arī hormons, ko ražo nieru juxtaglomerulārās šūnas.
Proteāzes ir fermenti, kas hidrolizē peptīdu saites un sadalās olbaltumvielas peptīdos vai aminoskābēs. Pepsīns ir proteāze, kas atrodas kuņģa sulā. Tas ir viens no galvenajiem gremošanas enzīmiem, kas olbaltumvielu pārtiku sadala peptīdos un aminoskābēs. Turpretī renīns ir ferments un asparagīna proteāze. Tas ir renīna-angiotenzīna sistēmas iniciatīvas enzīms. Renīns darbojas kā hormons un palīdz kontrolēt asinsspiedienu.