Galvenā atšķirība starp himēru un mozaīku ir katra organisma veidošanā iesaistīto zigotu skaits. Dažādas šūnu populācijas rodas no divām zigotām himērā, savukārt dažādas šūnu populācijas - no vienas zigotas mozaīkā.
Kimēra un mozaīka sākotnēji bija mītiski ģenētiskās kombinācijas jēdzieni. Tomēr, attīstoties ģenētikai un molekulārajai bioloģijai, tagad ir iespējams zinātniski izskaidrot kimērisma un mozaīka parādības. Gan kimērismā, gan mozaīkā dažām ķermeņa šūnām ir atšķirīgs genoms. Tādējādi tie paši audi var saturēt divas vai vairākas dažādas šūnu populācijas. Turklāt divas zigotas piedalās embrija veidošanā, kas attīstās par himēru, savukārt viena zigota piedalās embrija veidošanā, kas attīstās mozaīkā. Agrīnā attīstības mutācija ir mozaīkas cēlonis, savukārt divu dažādu zigotu iesaistīšana ir kimērisma iemesls.