Galvenā atšķirība starp sakneņu un stolonu ir tāda, ka sakneņi ir saknēm līdzīgi galvenie stublāji, kas aug pazemē, savukārt stoloni ir kātiņi, kas sadīguši no esošā stumbra, kas horizontāli iet tieši zem augsnes virsmas, lai izveidotu jaunu augu un izveidotu savienojumu ar mātes augu.
Sakneņi un stoloni ir īpašas augu struktūras. Viņiem ir izšķiroša nozīme veģetatīvās reprodukcijas procesā. Abās daļās var uzglabāt arī pārtikas produktus. Ne tikai tas, ka abi augiem palīdz izdzīvot skarbos vides apstākļos. Strukturāli tie ir kāti. Sakneņi ir galvenais kāts, kas atrodas pazemē, savukārt stolons ir kāts, kas sadīgts no galvenā kāta, kas horizontāli iet uz zemes.