Galvenā atšķirība starp aktīvo un pasīvo difūziju ir tāda, ka aktīvā difūzija vai aktīvais transports izmanto enerģiju molekulu transportēšanai pret koncentrācijas gradientu, savukārt pasīvajai difūzijai enerģija nav nepieciešama, jo tā notiek gar koncentrācijas gradientu.
Ir dažādi transporta sistēmu veidi, kas palīdz pārvietot vielas no vienas vietas uz otru. Būtībā ir divi transporta mehānismi; tie ir aktīvais un pasīvais transports vai difūzija. Galvenais aktīvās un pasīvās difūzijas atšķirības kritērijs ir enerģijas patēriņš. Aktīvs transports patērē enerģiju, bet pasīvajam transportam nav nepieciešama enerģija. Turklāt ir vēl dažas atšķirības starp aktīvo un pasīvo difūziju. Šī raksta galvenais mērķis ir apspriest šīs atšķirības, vienlaikus sniedzot izpratni par abiem mehānismiem.