Galvenā atšķirība starp asimilējošo un disimilējošo sulfātu reducēšanu ir tāda, ka asimilējošā sulfāta reducēšana rada cisteīnu kā galaproduktu, bet disimilējošā sulfāta reducēšana rada sulfīdu kā gala produktu.
Sulfātu samazināšana ir viens no galvenajiem anaerobajiem elpošanas ceļiem. Turklāt daži mikrobi, kas ir atkarīgi no anaerobiem apstākļiem, spēj samazināt sulfātus, lai iegūtu enerģiju. Turklāt ir divi galvenie ceļi, kuros sulfāti samazinās; tie ir asimilācijas ceļš un disimilācijas ceļš. Tajā asimilācijas ceļā sulfāta reducēšana rada cisteīnu kā galaproduktu, ko var asimilēt dzīvos organismos, piemēram, augos un augstākajos eikariotos. Gluži pretēji, sulfāta reducēšanas disimilācijas ceļš dod sulfīdu kā gala produktu. Tādējādi visnozīmīgākā, atšķiramākā atšķirība starp asimilējošo un disimilējošo sulfātu reducēšanu ir katra produkta galaprodukta veids.
