Galvenā atšķirība starp hlorofilu A un B ir tā, ka hlorofils A ir primārais fotosintētiskais pigments augos un aļģēs, savukārt hlorofils B ir papildu pigments, kas savāc enerģiju un pāriet uz hlorofilu A.
Hlorofils ir dabisko pigmentu saime, kas atrodas augos un aļģēs un ir atbildīga par to zaļo krāsu. Hlorofils absorbē saules gaismas enerģiju un izmanto šo enerģiju, lai sintezētu ogļhidrātus no ūdens un oglekļa dioksīda. Tas ir process, ko sauc par fotosintēzi, kas uztur dzīvības procesus visos augos, jo ar šo procesu tiek apmierinātas to enerģijas prasības. Turklāt fotosintēze ir galvenais process, kas uztur visus dzīvos organismus, jo augi ir visu pārtikas ķēžu primārie ražotāji. Dzīvnieki un cilvēki patērē augu produktus. Hlorofila pigmentu ģimenē ir vairāki hlorofila pigmentu veidi. Starp tiem hlorofils A un hlorofils B ir divu veidu hlorofili. Viņiem ir līdzīga struktūra ar nelielu porfirīna gredzena atšķirību. Hlorofilam A ir CH3 grupas porfirīna gredzenā, savukārt hlorofilam B porfirīna gredzenā ir CHO (aldehīda grupa).
