Galvenā atšķirība starp cilmes līnijas mutāciju un somatisko mutāciju ir tāda, ka cilmes līnijas mutācija tiek pārmantota pēcnācējiem, savukārt somatiskā mutācija nav raksturīga pēcnācējiem.
DNS ir vairuma dzīvo organismu iedzimtības materiāls. Mutācija ir pastāvīga DNS fragmenta vai gēna nukleotīdu secības maiņa. Dzīvos organismos notiek dažāda veida mutācijas. Starp tiem somatiskās mutācijas un cilmes līnijas mutācijas ir divi galvenie veidi. Somatiskās mutācijas notiek atsevišķās ķermeņa šūnās, savukārt dzimumšūnu mutācijas - gametās. Kad somatiskā mutācija notiek vienā ķermeņa šūnā, tā ietekmē tikai audus, kas rodas no mutācijas šūnas. Pretstatā tam visas ķermeņa šūnas ietekmē, kad notiek cilmes līnijas mutācija. Galvenā atšķirība starp dzimumšūnu mutāciju un somatisko mutāciju ir šo mutāciju iespēja pāriet pēcnācējos vai nē.
