Galvenā atšķirība starp somatisko un Germline gēnu terapiju ir atkarīga no šūnu veida, ko izmanto gēnu terapijas veikšanai. Somatiskā gēnu terapija attiecas uz gēnu ieviešanu vai pārveidošanu somatiskajās šūnās. Germline gēnu terapija attiecas uz gēnu ievadīšanu vai pārveidošanu dzimumšūnās.
Gēnu terapija pašlaik ir gaidāmā ārstēšanas joma, jo tā ir vērsta uz slimības cēloni. Mainot gēnus, kas ir atbildīgi par konkrētu slimības stāvokli, ir iespējams slimību novērst agrīnā stadijā. Tāpēc gēnu terapija ir parādījusi jaunas metodes slimību ārstēšanā un slimību likvidēšanā.