Galvenā atšķirība starp glikogēnām un ketogēnām aminoskābēm ir tā, ka glikogēnās aminoskābes katabolizācijas laikā rada piruvātu vai citus glikozes prekursorus, savukārt ketogēnās aminoskābes katabolizācijas laikā ražo acetil CoA un acetoacetil CoA.
Aminoskābes ir pamatmolekulas, kas veido olbaltumvielu un polipeptīdu ķīmisko struktūru. Lai gan aminoskābēm ir dažādas klasifikācijas, mēs varam tās klasificēt kā glikogēnās un ketogēnās aminoskābes atkarībā no starpproduktiem, ko tās veido katabolisma laikā. Kā minēts iepriekš, aminoskābju katabolizācijas gala produkts dod divu veidu starpproduktus; vai nu piruvāts (vai citiem glikozes prekursoriem), vai acetil CoA un acetoacetil CoA.