Galvenā atšķirība - Metabolomics vs Metabonomics
Metabolīti ir mazās molekulas, kas iesaistītas vielmaiņas reakcijās šūnās. Metabolīti ietver vielmaiņas starpproduktus, hormonus, sekundāros metabolītus, signālmolekulas utt. Tie ir šūnu bioķīmisko reakciju funkcionējošās molekulas. Pilns bioloģiskā parauga vai viena organisma metabolītu komplekts ir pazīstams kā metaboloms. Metabolome ir dinamiska kolekcija, kas organismā mainās katru sekundi. Metabolomika un metabonomika ir divi termini, kas saistīti ar organisma metaboloma izpēti. Galvenā atšķirība starp metabolomiku un metabonomiku ir tāda, ka metabolomiku vairāk uztrauc normāla endogēna vielmaiņa un metaboliskā profilēšana šūnu vai orgānu līmenī, savukārt metabonomika ir saistīta ar metabolisma profilēšanas paplašināšanu ar informāciju par vielmaiņas traucējumiem vides faktoru, slimību, zarnu ietekmē. mikroorganismi un metabolisma profilēšanas salīdzināšana utt. Metabolomiku galvenokārt virza masu spektrometrija, un metabonomika metabolītu analīzei izmanto KMR spektroskopiju.
SATURS
1. Pārskats un galvenās atšķirības
2. Kas ir metabolometika
3. Kas ir metabonomika
4. Blakus salīdzinājums - Metabolomika pret metabonomiku
5. Kopsavilkums
Kas ir Metabolomics?
Metabolomika ir metabolisma procesu izpēte, kas notiek šūnās, bioloģiskajos šķidrumos, audos vai organismos. Tas ietver šūnu metabolītu identifikāciju un kvantitatīvu noteikšanu, izmantojot labus analīzes un statistikas rīkus. Metabolomika tiek uzskatīta par svarīgu pētījumu, jo tā atklāj informāciju par organisma metabolismu.
Lai izpētītu metabolisko reakciju substrātus un produktus, metabolomika kā analītisko platformu izmanto masu spektrometriju. Masu spektrometrija atklāj metabolītu veidus un to koncentrāciju, atspoguļojot šūnu vai audu faktisko bioķīmisko stāvokli. Tādējādi metabolomiku var uzskatīt par labāko organisma molekulārā fenotipa pārstāvi. Metabolomika ir mazo organismu molekulu omiskā tehnoloģija, un to salīdzina ar citiem omiskiem pētījumiem; metabolomika ir ļoti svarīga, jo tā tieši atspoguļo šūnu bioķīmiskās reakcijas pašreizējo stāvokli.
Metabolomiku var uzskatīt arī par proteomikas paplašinājumu, jo tā rodas fermentu aktivitātes dēļ, kas ir olbaltumvielas, kā parādīts nākamajā attēlā.
01. attēls: Metabolomikas shēma
Kas ir metabonomika?
Metabonomika tiek definēta kā daudzparametru metabolisko reakciju kvantitatīvs mērījums noteiktā laikā saistībā ar patofizioloģiskiem stresiem vai ģenētiskām modifikācijām. To parasti piemēro pētījumiem, kas veikti par cilvēka uzturu un reakciju uz narkotikām vai slimībām. Šīs pieejas aizsācējs bija Džeremijs Nikolsons no Imperatora koledžas, Londonā, un to izmantoja vairākās jomās, tostarp toksikoloģijā, slimību diagnostikā, uztura jomā utt. Vēsturiski metabonomika bija viena no pirmajām metodēm, kas piemēroja sistēmu bioloģijas jomu pētījumiem metabolismu.
Metabonomika vairāk rūpējas par bioķīmisko profilu salīdzināšanu, nevis par atsevišķu metabolisko savienojumu identificēšanu metabolomikā. Tāpēc metabonomiku var definēt kā metabolomikas apakškopu. Tajā galvenokārt uzsvērts dažādu populāciju metabolisma profilu salīdzinājums attiecībā uz slimībām, vides stresu, ģenētisko modifikāciju, uzturu, narkotikām utt., Jo metabolīti ir labi marķieri, kas norāda uz slimības apstākļiem, zāļu iedarbību, vides stresu, toksīnu iedarbību utt.
Metabonomiskie pētījumi atklāj gan intracelulāros, gan ārpusšūnu metabolītus. Tas izmanto augstas caurlaidspējas paņēmienus, lai vienlaikus un atkārtoti analizētu lielu skaitu metabolītu, ļaujot savlaicīgi izpētīt šūnu fizioloģisko stāvokli. Tas arī atklāj korelāciju starp metabolītiem un organisma patoloģisko stāvokli. Metabonomisko pētījumu atbalstam var izmantot genomiku un proteomiku, jo tās ir savstarpēji saistītas, kā parādīts iepriekšējā attēlā.
Kāda ir atšķirība starp metabolometiku un metabonomiku?
Atšķirīgs raksts vidū pirms tabulas
Metabolomika vs metabonomika |
|
| Metabolomika ir visa organisma metabolītu kompleksa izpēte | Metabonomika ir kvantitatīvs pētījums par dzīvu sistēmu daudzparametriskām vielmaiņas reakcijām īslaicīgi uz patofizioloģiskiem stimuliem vai ģenētiskām modifikācijām. |
| Galvenā problēma | |
| Metabolomika vairāk attiecas uz vielmaiņas profilēšanu un atsevišķu šūnās esošo metabolītu identificēšanu. | Metabonomika ir vairāk saistīta ar metabolītu vai populāciju metabolisko profilu salīdzināšanu saistībā ar ģenētiskām modifikācijām, slimībām, vides stresu, patoloģiskiem stimuliem, zālēm utt. |
| Informācija | |
| Metabolomika galvenokārt ir vērsta uz endogēno metabolismu. | Metabonomika neaprobežojas tikai ar endogēno metabolismu. Tas aptver informāciju par vielmaiņas traucējumiem, ko izraisa iekšējie un ārējie faktori, piemēram, uztura modeļi, toksīni, slimības procesi utt. |
| Analītiskie rīki | |
| Tā izmanto masu spektrometriju kā galveno analītisko platformu | Metabonomika kā galveno analītisko platformu izmanto KMR spektroskopiju. |
Kopsavilkums - Metabolomics vs Metabonomics
Metaboloma pārstāv pilnu mazu molekulu, ko sauc par metabolītiem, kopumu, kas atrodas šūnā vai organismā. Metabolomika ir visa metaboloma izpēte, lai izveidotu vielmaiņas profilu. Metabolomika ļauj zinātniekiem izmērīt faktisko šūnas vai organisma fizioloģisko stāvokli. Metabonomika ir metabolomikas daļa, kas paplašina informāciju par dzīvo sistēmu daudzparametriskajām vielmaiņas reakcijām uz patofizioloģiskajiem stimuliem un ģenētiskajām modifikācijām. Metabonomika attiecas ne tikai uz individuālu metabolisko profilēšanu, piemēram, metabolomiku; tajā tiek salīdzināti vielmaiņas profili saistībā ar citiem faktoriem, piemēram, vides stresu, slimībām, toksīniem utt. Gan metabolomikā, gan metabonomikā ir iesaistīti organismu metabolītu pētījumi, lai noteiktu šūnu faktisko fizioloģisko stāvokli. Tādējādidažreiz šie divi tiek uzskatīti par sinonīmiem, neņemot vērā atšķirību starp metabolomiku un metabonomiku.
