Galvenā atšķirība starp F plazmīdu un R plazmīdu ir tā, ka F plazmīds ir ārpushromosomu DNS, kas satur auglības faktoru kodējošus gēnus. Tikmēr R plazmīds ir ārpushromosomu DNS, kas satur gēnus, kas kodē rezistenci pret antibiotikām.
Plazmīda ir maza cirkulāra divšķiedru DNS, kas atrodas baktērijās. Tie ir ārpushromosomu DNS un spēj sevi replikēt. Viņiem ir gēni, kas nepieciešami viņu pašu replikācijai un uzturēšanai. Līdztekus sevis replikācijai nepieciešamo gēnu saturēšanai plazmīdās ir arī vairāki citi nepieciešamie gēni īpašu pazīmju kodēšanai, piemēram, rezistence pret antibiotikām, makromolekulu noārdīšanās, smago metālu tolerance, bakteriocīnu ražošana, gēnu pārnese utt. labvēlīgs baktērijām.
Turklāt ir ļoti dažādas plazmīdas. R plazmīdas un F plazmīdas ir divu veidu. F plazmīds ir auglības plazmīds, kas spēj konjugēt un radīt dzimuma pili. R plazmīds ir rezistences plazmīds, kas spēj nodrošināt rezistenci pret antibiotikām un dažiem baktēriju augšanas inhibitoriem.
