Galvenā atšķirība starp plazmīdu un hromosomu ir tā, ka plazmīds ir cirkulāra baktēriju divkāršota ārpushromosomu DNS struktūra, savukārt hromosoma ir labi organizēta pavedienveidīga struktūra, kas satur genomu DNS, kas cieši savijusies ar olbaltumvielām.
Baktēriju šūnā ir hromosoma un vairāki ārpushromosomu DNS apļi, kurus sauc par plazmīdām. Baktēriju hromosomā ir baktēriju genomiskā DNS. Turklāt eikariotu genomu DNS pastāv arī kā hromosomas. Cilvēka genomā ir 46 hromosomas. Parasti plazmīdas ir baktērijās un arhejās. Lai arī baktērijām ir plazmīdas, plazmīdās nav gēnu, kas ir būtiski baktēriju izdzīvošanai un to galvenajām funkcijām. Tomēr plazmīdās ir vairāki gēni, kas baktērijām sniedz papildu priekšrocības, piemēram, rezistence pret antibiotikām, sausuma tolerance, rezistence pret herbicīdiem utt. Šī raksta mērķis ir detalizēti apspriest atšķirību starp plazmīdu un hromosomu.
