Galvenā atšķirība starp hromosomu un hromatīdu ir tā, ka hromosoma ir gara pavedienveida DNS molekulas forma, bet hromatīds ir puse no divām identiskām kopiju replikētas hromosomas. Faktiski divas hromatīdas ir savienotas kopā ar centromēru, veidojot hromosomu.
Hromosomas un hromatīdi ir cieši saistītas struktūras, kas izgatavotas no DNS molekulām. Hromosomās ir ģenētiska informācija specifisku DNS sekvenču vai gēnu veidā. Vienu DNS virkni sauc par hromosomu, un divi hromatīdi veidos vienu hromosomu. Hromosomas ir viena organisma vektori vai ģenētisko materiālu pārvadāšana uz otru, savukārt hromatīdi ļauj šīm šūnām dublēties.