Galvenā atšķirība starp acidofīlām un bazofilām ir tā, ka šūnas acidofilie komponenti ir skābi mīloši un to krāsošanai tiek izmantotas skābās krāsas, savukārt šūnas bazofilās sastāvdaļas ir bāzes mīlošās, un to krāsošanai tiek izmantotas bāzes krāsas.
Krāsošana ir metode, ko izmanto, lai vizualizētu šūnas un to komponentus, jo daudzas šūnas ir bezkrāsainas un caurspīdīgas. Daži šūnas komponenti mīl skābi, bet daži - bāzi. Skābās krāsvielas un bāzes krāsvielas ir divu veidu krāsas, kuras bieži izmanto paziņošanas procedūrās. Krāsojot bazofilā krāsā, tiek izmantotas pamata krāsas, bet skābā krāsā - skābes. Tāpēc acidofilie vai skābi mīlošie komponenti saistās ar skābām krāsvielām, bet bazofilie vai bāzes mīlošie komponenti - ar pamata krāsvielām.