Galvenā atšķirība - bāzes izgriešanas remonts pret nukleotīdu izgriešanas remontu
DNS bieži tiek pakļauta bojājumiem dažādu iekšēju un ārēju faktoru dēļ. Tomēr šūnu remonta sistēmas nekavējoties un pastāvīgi novērš bojājumus, pirms tie kļūst par mutācijām vai pirms tie tiek nodoti nākamajām paaudzēm. Šūnās ir trīs veidu izgriešanas labošanas sistēmas: nukleotīdu izgriešanas remonts (NER), bāzes izgriešanas remonts (BER) un DNS neatbilstības labojums (MMR), lai izlabotu vienas virknes DNS bojājumus. Galvenā atšķirība starp bāzes izgriešanas remontu un nukleotīdu izgriešanas remontu ir tā, ka bāzes izgriešanas remonts ir vienkārša remonta sistēma, kas darbojas šūnās, lai novērstu endogēniski radītos viena nukleotīda bojājumus, savukārt nukleotīdu izgriešanas remonts ir sarežģīta remonta sistēma, kas šūnās darbojas salīdzinoši lielāki, bojāti reģioni, ko izraisa eksogēni.
SATURS
1. Pārskats un galvenās atšķirības
2. Kas ir bāzes izgriešanas remonts
3. Kas ir nukleotīdu izgriešanas remonts
4. Blakus salīdzinājums - bāzes izgriešanas remonts pret nukleotīdu izgriešanas remontu
5. Kopsavilkums
Kas ir bāzes izgriešanas remonts?
Bāzes izgriešanas remonts ir vienkāršākā DNS atjaunošanas sistēmas versija, kāda ir šūnām. To izmanto nelielu DNS bojājumu novēršanai. DNS bāzes tiek modificētas dezaminācijas vai alkilēšanas dēļ. Ja ir bāzes bojājumi, DNS glikozilāze atpazīst un aktivizē bāzes izgriešanas remonta sistēmu un atgūst to ar enzīmu AP endonukleāzes, DNS polimerāzes un DNS ligāzes palīdzību. BER sistēmā ir iesaistīti šādi soļi.
- Nepareizas vai bojātas bāzes atpazīšana un noņemšana ar DNS glikozilāzes palīdzību, lai izveidotu abazisku vietu (bāzes zuduma vietas –apiurīniskās vai apirimidīniskās vietas).
- Apurīniskās / apirimidīniskās endonukleāzes griezums abasijas vietā
- Atlikušā cukura fragmenta noņemšana ar liāzi vai fosfodiesterāzi
- Spraugas aizpildīšana ar DNS polimerāzi
- Nika aizzīmogošana ar DNS ligāzi
01. attēls: Bāzes izgriešanas remonta ceļš
Kas ir nukleotīdu izgriešanas remonts?
Nukleotīdu izgriešanas labošana (NER) ir svarīga DNS izgriešanas atjaunošanas sistēma šūnās. Tas spēj salabot un nomainīt bojātos reģionus, kuru garums ir līdz 30 pamatiem, un to vada nesabojāta veidnes daļa. Kopējie DNS bojājumi rodas ultravioletā starojuma dēļ, un NER aizsargā DNS, novēršot šos bojājumus tieši pirms mutācijas un nodošanas nākamajām paaudzēm vai izraisot slimības. NER īpaši nodrošina aizsardzību pret mutācijām, ko netieši izraisa eksogēni faktori, piemēram, vides un ķīmiskie kancerogēni. NER ir redzams gandrīz visos organismos, un tas atzīst bojājumus, kas izraisa būtiskus DNS spirāles izkropļojumus.
NER process ietver daudzu olbaltumvielu, piemēram, XPA, XPB, XPC, XPD, XPE, XPF, XPG, CSA, CSB utt., Darbību un turpinās, izmantojot vairākus sagrieztus un pastas veida mehānismus. Šīs olbaltumvielas ir būtiskas, lai pabeigtu remonta procesu, un viena no NER olbaltumvielām defekts ir vitāli svarīgs un var izraisīt retus recesīvus sindromus: xeroderma pigmentosum (XP), Cockayne sindromu (CS) un trauslo matu traucējumu fotosensitīvo formu. trichotiodistrofija (TTD).
02. attēls: Nukleotīdu izgriešanas remonts
Kāda ir atšķirība starp bāzes izgriešanas remontu un nukleotīdu izgriešanas remontu?
Atšķirīgs raksts vidū pirms tabulas
Bāzes izgriešanas remonts pret nukleotīdu izgriešanas remontu |
|
| Bāzes izgriešanas remonts (BER) ir DNS atjaunošanas sistēma, kas notiek šūnās. | Nukleotīdu izgriešanas remonts (NER) ir vēl viens šūnās atrodams DNS atjaunošanas sistēmas veids. |
| Atpazīstot DNS adduktus | |
| BER novērš nelielu DNS adduktu bojājumus. | NER labo lielus DNS adduktus. |
| DNS bojājumi | |
| BER atzīst bojājumus, kas nerada būtiskus DNS spirāles izkropļojumus. | NER atzīst bojājumus, kas izraisa būtiskus DNS spirāles izkropļojumus. |
| DNS bojājumu cēloņi | |
| BER novērš endogēno mutagēnu radītos bojājumus. | NER novērš eksogēno mutagēnu radītos bojājumus. |
| Sarežģītība | |
| BER ir vismazāk sarežģītā remonta sistēma | Tas ir sarežģītāk nekā BER. |
| Nepieciešamība pēc olbaltumvielām | |
| BER nav nepieciešami citi proteīni. | NER prasa vairākus gēnu produktus, īpaši olbaltumvielas, lai atšķirtu bojātos un nebojātos reģionus. |
| Piemērotība | |
| BER ir piemērots vienas bāzes bojājumu novēršanai. | NER ir piemērots bojāto reģionu aizstāšanai. |
Kopsavilkums - bāzes izgriešanas remonts pret nukleotīdu izgriešanas remontu
NER un BER ir divu veidu DNS izgriešanas remonta procesi, kas atrodami šūnās. BER spēj novērst nelielus bojājumus, kas radušies endogēni, savukārt NER - bojājumus reģionos, kuru garums ir līdz 30 bāzes pāriem un kurus galvenokārt izraisa eksogēni. BER no NER atšķiras ar atpazīto substrātu tipiem un sākotnējā šķelšanās gadījumā. BER var arī atpazīt bojājumus, kurus nav izraisījuši nozīmīgi DNS spirāles sagrozījumi, savukārt NER atzīst būtiskus DNS spirāles izkropļojumus. Šī ir atšķirība starp bāzes izgriešanas remontu un nukleotīdu izgriešanu.
Attēla pieklājība:
1. “Dna repair base excersion en” Autors LadyofHats - (Public Domain), izmantojot Commons Wikimedia
2. “Shematisks modeļu attēlojums nukleotīdu izgriešanas remonta ceļam, ko kontrolē Uvr olbaltumvielas”. Rihito Morita, Shuhei Nakane, Atsuhiro Shimada, Masao Inoue, Hitoshi Iino, Taisuke Wakamatsu, Kenji Fukui, Noriko Nakagawa, Ryoji Masui un Seiki Kuramitsu - (CC BY 1.0), izmantojot Commons Wikimedia
