Galvenā atšķirība starp antigēnu un antivielām ir tā, ka antigēns ir jebkura viela, kas stimulē imūnsistēmu radīt antivielas pret to, savukārt antivielas ir Y formas imūnglobulīna aizsargājošs proteīns, kas spēj saistīties ar antigēniem, lai tos neitralizētu.
Imunoloģijas pamatpratība, kā arī daži mikrobioloģijas, patoloģijas un dermatoloģijas aspekti balstās uz antigēna-antivielu reakciju pamatjēdzienu izpratni. Tie ir plašo zināšanu un jaunizveidoto tehnoloģiju pamatelementi dažādu slimību daudzuma apkarošanai.