Galvenā atšķirība starp dominējošajām un recesīvajām alēlēm ir tā, ka dominējošās alēles ir tās alēles, kas dod fenotipu, maskējot pārējo fenotipu, savukārt recesīvās alēles ir tās alēles, kuras nomāc dominējošā alēle.
Parasti hromosomā ir vairāki gēni, un tie pastāv noteiktās vietās. Ja gēni eksistē vienā un tajā pašā vietā homologo hromosomās, tiek uzskatīts, ka tiem ir vienāds lokuss. Tā kā tie atrodas vienā un tajā pašā mātes un tēva hromosomas lokusā, šiem gēniem ir tāda pati iezīme. Tās ir alternatīvas gēna formas; mēs saucam šīs alēles. Alēles var būt dominējošas vai recesīvas. Dominējošā alēle vienmēr dod tā kodēto fenotipu, savukārt recesīvā alēle dod fenotipu tikai tad, ja tas atrodas homozigotajā stāvoklī. Faktiski dominance un recesivitāte ir divu alēļu fenotipiskā korelācija.
