Galvenā atšķirība starp sprieguma vārtiem un ligandu novadītiem jonu kanāliem ir tā, ka sprieguma aizturētie jonu kanāli tiek atvērti, reaģējot uz sprieguma starpību, bet ligandu vārti kanāli atveras, reaģējot uz liganda saistīšanos.
Membrānas transports ir svarīgs mehānisms, kas ļauj joniem iekļūt šūnā un atbrīvot to. Tādējādi jonu kanāli ir svarīgas molekulas, kas palīdz membrānas transportēšanā. Neskatoties uz to, lielākā daļa jonu kanālu ir iestrādāti šūnu membrānā, un tie ir olbaltumvielas. Tomēr daži var būt kanāla proteīni, bet citi ir nesēji. Kanāla proteīni ir divu veidu; vārti kanāli vai bez vārtiem kanāli. Ieejas jonu kanāli ir trīs veidi; proti, ar spriegumu saistīti, ar ligandu vārti un stresa iedarbināti jonu kanāli. Abu kanālu ieejas puse parasti pastāv kā slēgta, un tie tiek atvērti tikai īpašos apstākļos.
