Galvenā atšķirība starp jonu pāri un jonu apmaiņas hromatogrāfiju ir tāda, ka jonu pāru hromatogrāfijā jonus paraugā var “savienot pārī” un atdalīt kā jonu pāri, savukārt jonu apmaiņas hromatogrāfijā jonus paraugā var atdalīt kā katjonus un anjonus atsevišķi.
Hromatogrāfija ir svarīga tehnika, kas noved pie dažādu komponentu atdalīšanas maisījumā. Jonu pāra un jonu apmaiņas hromatogrāfija ir analītiskas metodes, kuras mēs varam izmantot, lai atdalītu jonus un polārās molekulas maisījumā, pamatojoties uz elektrisko lādiņu, ko tie nes sev līdzi.