Galvenā atšķirība starp kodominanci un vairākām alēlēm ir tā, ka kodominance abu alēļu ietekmi izsaka neatkarīgi, nesajaucoties heterozigotajā stāvoklī, savukārt vairākas alēles attiecas uz pazīmes stāvokli, kurai ir vairāk nekā divas dažādas alēles.
Parasti katram gēnam ir divas dažādas alēles. Viens ir dominējošā alēle, bet otrs ir recesīvs alēle. Saskaņā ar Mendeli mantojumu dominējošā alēle izsaka savu fenotipu, vienlaikus nomācot recesīvo alēli heterozigotajā stāvoklī. Tomēr dažiem gēniem ir trīs vai vairāk dažādas alēles vienai īpašībai. Tos sauc par vairākām alēlēm. Turklāt kodominance ir mantojums, kas nav Mendeli. Šajā parādībā pēcnācēji saņem abus vecāku gēnus kā abu gēnu kombināciju. Tāpēc pēcnācējos abi gēni tiek izteikti vienādi.
