Galvenā atšķirība starp fagocitozi un pinocitozi ir tāda, ka fagocitoze ir endocitozes forma, kas cietās vielas caur plazmas membrānu uzņem šūnā, savukārt pinocitoze ir vēl viena endocitozes forma, kas šķidrumu, ieskaitot izšķīdušās vielas un mazās molekulas, caur plazmas membrānu uzņem šūnā.
Endocitoze ir mehānisms, ar kura palīdzību šūnas šūnā uzņem makromolekulas un citas suspendētās daļiņas, ieskaitot šūnu daļas, makromolekulāros agregātus un svešas daļiņas. Eksocitoze ir pretējs endocitozes mehānisms, ar kura palīdzību šūnas izslēdz vielas no šūnām. Eksocitoze galvenokārt notiek sekrēcijas šūnās. Ir divi endocitozes veidi, pamatojoties uz daļiņu raksturu, kas tiek uzņemtas dzīvās šūnās. Tie ir fagocitoze un pinocitoze. Abos procesos izmantotais mehānisms ir vienāds. Tie veido pūslīšus, kas ieskauj materiālus, lai tos uzņemtu iekšā. Abi procesi ir aktīvi procesi. Tādējādi jūs varat novērot mitohondriju to virsmu tuvumā, kur notiek šie procesi.