Galvenā atšķirība starp substrātu un aktīvo vietu ir tā, ka substrāts ir ķīmisks savienojums, kas var pakļauties ķīmiskai reakcijai, turpretī aktīvā vieta ir specifisks fermenta reģions.
Fermenti ir bioloģiskie katalizatori. Tie ir proteīni, kas var samazināt ķīmiskās reakcijas aktivācijas enerģiju, lai samazinātu šīs reakcijas enerģijas barjeru. Tādējādi tas var palielināt reakcijas ātrumu. Reakcijas reaģents, kurā iesaistīti fermenti, ir “substrāts”. Šis substrāts saistās ar fermenta aktīvo vietu. Reakcijas notiek tur. Galu galā tas atbrīvo reakcijas produktus.
