Galvenā atšķirība starp iso un neo struktūrām ir tā, ka prefikss iso attiecas uz organisko savienojumu, kas satur visus oglekļa atomus, izņemot to, kas veido nepārtrauktu ķēdi, turpretī prefikss neo attiecas uz organisku savienojumu, kas satur visus oglekļa atomus, izņemot divus, kas veido nepārtrauktu ķēdi.
Organiskajā ķīmijā mēs izmantojam prefiksus, lai atšķirtu vienu organisko molekulu no citas. Mēs izmantojam šos prefiksus kopā ar savienojuma nosaukumu. Tā kā šie prefiksi ir specifiski dažādām organisko molekulu funkcionālajām grupām, mēs varam viegli identificēt organiskās molekulas, pat ja tām ir cieši saistītas ķīmiskās struktūras.
