Galvenā atšķirība starp KMR un rentgena kristalogrāfiju ir tā, ka KMR ir analītisks paņēmiens, ko izmanto organisko molekulu atomu veida un skaita noteikšanai, savukārt rentgena kristālogrāfija ir analītiska metode, ko izmanto, lai noteiktu kristāla atomu un molekulāro struktūru.
Termins NMR apzīmē kodolmagnētisko rezonansi. Šis termins ietilpst analītiskās ķīmijas apakštēmas spektroskopijā. Savukārt rentgena kristālogrāfija ir kristalogrāfijas paņēmiena veids, kurā kristālu analīzei mēs izmantojam rentgena staru.
