Galvenā atšķirība starp funkcionālo grupu un aizvietotāju ir tā, ka funkcionālā grupa ir molekulas aktīvā daļa, turpretī aizvietotājs ir ķīmiska viela, kas molekulā var aizstāt atomu vai atomu grupu.
Termini funkcionālā grupa un aizvietotājs bieži sastopami organiskajā ķīmijā. Funkcionālā grupa ir īpašs aizvietotāju veids, kas izraisa molekulas aktivitāti. Tas nozīmē, ka reakcijas, kas notiek noteiktā molekulā, nosaka funkcionālā grupa. Tomēr aizvietotājs var būt vai nu aktīvā ķīmiskā suga, vai neaktīvā ķīmiskā viela.
