Galvenā atšķirība starp primārajiem un sekundārajiem metabolītiem ir tā, ka primārie metabolīti ir vielmaiņas galaprodukti, kas tieši piedalās organisma normālā augšanā, attīstībā un reprodukcijā, bet sekundārie metabolīti ir metabolīti, kas tieši nepiedalās normālā organisma augšanā, attīstībā un reprodukcijā. organisms.
Metabolīti metabolisma procesā piedalās organismu augšanā. Metabolisms ir visu organismā notiekošo bioķīmisko reakciju summa. Atkarībā no izcelsmes un funkcijas ir divas galvenās metabolītu kategorijas. Tie ir primārie metabolīti un sekundārie metabolīti.