Galvenā atšķirība starp sēnēm un parazītiem ir tā, ka sēnes ir eikariotu saprotrofisko organismu grupa, ieskaitot raugus, pelējuma sēnes un sēnes, savukārt parazīti ir organismu grupa, kas dzīvo uz cita organisma vai tā iekšienē, iegūstot barības vielas.
Gan sēnītes, gan parazīti cilvēkiem izraisa dažādas slimības. Ne tikai cilvēkiem, bet parazīti izraisa slimības arī citiem dzīvniekiem un augiem. Parazīti ir organismi, kas parāda dzīves veidu, ko sauc par parazītismu. Parazītisms ir viens no trim simbiotisko attiecību veidiem, kas pastāv starp divām vai vairākām kopā dzīvojošām sugām. Atsevišķas sēņu sugas, daži kukaiņi, vienšūņi un helminti ir parazītu piemēri. Parazītismā parazīti dzīvo citā organismā vai tā iekšienē, ko sauc par saimnieku; parazītisms dod labumu tikai parazītiem, vienlaikus izraisot slimības tā saimniekam. Turklāt parazīti nevar izdzīvot bez saimniekiem.