Video: Starpība Starp BLAST Un FastA
2024 Autors: Mildred Bawerman | [email protected]. Pēdējoreiz modificēts: 2023-12-16 08:40
Galvenā atšķirība starp BLAST un FastA ir tā, ka BLAST ir pamata saskaņošanas rīks, kas pieejams Nacionālā biotehnoloģijas informācijas centra vietnē, savukārt FastA ir līdzības meklēšanas rīks, kas pieejams Eiropas Bioinformātikas institūta vietnē.
BLAST un FastA ir divas programmatūras, kuras tiek plaši izmantotas, lai salīdzinātu dažādu sugu DNS, aminoskābju, olbaltumvielu un nukleotīdu bioloģiskās sekvences un meklētu to līdzību. Šie algoritmi tika uzrakstīti, paturot prātā ātrumu. Tā kā, kad 1980. gadu vidū zinātnieki laboratorijā spēja izolēt DNS, tas radīja nepieciešamību salīdzināt un atrast identiskus gēnus turpmākiem pētījumiem lielā ātrumā. Tādējādi šīs divas programmatūras tika izstrādātas tā, lai lietotājs varētu ātri meklēt līdzīgas sekvences ar viņu vaicājumu secībām.
BLAST ir akronīms Basic Local Alignment Search Tool un izmanto lokalizētu pieeju, salīdzinot abas secības. FastA ir programmatūra, kas attiecas uz Fast A, kur A apzīmē visus. Šeit programmatūra darbojas ar tādiem alfabētiem kā Fast A DNS sekvencēšanai un Fast P olbaltumvielām. Gan BLAST, gan FastA ļoti ātri salīdzina jebkuru genoma datu bāzi un tāpēc ir ļoti dzīvotspējīgi naudas izteiksmē, kā arī ļauj ietaupīt laiku.
Ieteicams:
Starpība Starp Simetriskām Un Asimetriskām Augšējām Molekulām
Galvenā atšķirība starp simetriskām un asimetriskām augšējām molekulām ir tā, ka simetriskām augšējām molekulām ir viena pareiza rotācijas ass un divi inerces momenti
Starpība Starp Transgēnām Un Nokautām Pelēm
Galvenā atšķirība starp transgēnajām un izslēgtajām pelēm ir tā, ka transgēnu pelēm ir sveši gēni, kas ievietoti tās genomā, savukārt nokautajām pelēm ir funkcija
Starpība Starp DNS-RNS Hibrīdiem Un DsDNS
Galvenā atšķirība starp DNS-RNS hibrīdiem un dsDNS ir tā, ka DNS-RNS hibrīdi ir divvirzienu nukleotīdi, kas sastāv no vienas DNS virknes un viena komplementa
Starpība Starp Kraft Un Sulfīta Pulpingu
Galvenā atšķirība starp kraftpapīru un sulfīta mīkstumu ir tāda, ka kraftmīkstums ietver šķeldas apstrādi ar karstu ūdens, nātrija hidroksilu
Starpība Starp Frenulum Un Fourchette
Galvenā atšķirība starp frenulum un fourchette ir tāda, ka frenulum ir maza audu kroka, kas palīdz noenkurot daļēji kustīgu ķermeņa daļu, kamēr fourchette