Galvenā atšķirība starp DNS vakcīnu un rekombinanto vakcīnu ir atkarīga no vakcīnu sagatavošanas. DNS vakcīnas sagatavošana notiek, izmantojot vēlamos gēnus vai DNS fragmentus, savukārt rekombinantās vakcīnas sagatavošana notiek, izmantojot rekombinanto molekulu vai vektoru, kas satur vēlamo gēna fragmentu.
Vakcinācijas var izmantot kā profilaktiskas ārstēšanas metodes, kā arī terapeitiskus līdzekļus pret infekciju. Vakcinācijas ir daudzveidīgas. DNS un rekombinantās vakcīnas ir jaunākās formas. Turklāt šīs vakcīnas joprojām tiek pētītas.