Galvenā atšķirība starp mātes un tēva DNS testēšanu ir atkarīga no testēšanas procedūrā izmantotā DNS avota veida. Mātes DNS testēšanā tiek izmantota mitohondriju DNS, lai iegūtu mātes izcelsmi, savukārt tēva DNS pārbaudē Y-DNS tiek iegūta no tēva cilts.
Gan tēviņu, gan sieviešu dzimuma noteikšana ir svarīga, lai noteiktu ģimenes attiecības. Turklāt mātes un tēva DNS testi nosaka arī indivīdu identitāti. Daži no šajā analīzē izmantotajiem molekulārajiem paņēmieniem ir DNS pirkstu nospiedumu noņemšana, īsu tandēmu atkārtojumu analīze un ierobežojuma fragmenta garuma polimorfisms (RFLP).
