Galvenā atšķirība starp hromatīnu un hromosomām ir tā, ka hromatīns ir atlocīta un atlocīta DNS, kas pastāv kā DNS un histona olbaltumvielu komplekss, savukārt hromosomās ir visaugstākā kondensētā DNS dubultās spirāles struktūra, lai pareizi atdalītu ģenētisko materiālu starp meitas šūnām.
Hromatīns un hromosoma ir divas DNS dubultās spirāles struktūru kategorijas, kas atrodas dažādās šūnas stadijās. Eksistencei ir svarīgi iesaiņot visu DNS, kas glabā šūnas ģenētisko informāciju, eikariotu kodolā. Tādējādi hromatīns ir parastā iepakotās DNS forma šūnā. No otras puses, hromosomas ir vissvarīgākās šūnas struktūras šūnu dalīšanās laikā, un tās satur ģenētisko materiālu DNS formā. Tas ir tāpēc, ka viņi ir atbildīgi par iedzimtas informācijas nodošanu no paaudzes paaudzē. Ir divu veidu hromosomas kā autosomas un dzimuma hromosomas. Dzimuma hromosomas ir svarīgas dzimuma noteikšanā, savukārt autosomas nosaka citas īpašības. Parasti hromosomas parādās šūnu dalīšanās metafāzes laikā.
