Galvenā atšķirība starp klasisko un moderno ģenētiku ir tā, ka klasiskā ģenētika ir Mendeli ģenētika vai vecāka ģenētikas koncepcija, kas izteikta tikai, pamatojoties uz selekcijas eksperimentu rezultātā iegūtajiem fenotipiem, savukārt mūsdienu ģenētika ir jaunā ģenētikas koncepcija, kas ļauj tieši genotipu un fenotipu izpēte.
Lielais zinātnieks Gregors Mendels ir ģenētikas tēvs. Mendels ieviesa vairākus likumus par pazīmju pārmantošanu un to, kā iezīmes pāriet no vecākiem uz pēcnācējiem. Tādējādi viņa atklājumi kļuva par pamatu pilnīgi jaunajai koncepcijai, kas vēlāk tika atklāta ģenētikā. Tāpēc klasiskā ģenētika un mūsdienu ģenētika ir divi atšķirīgi jēdzieni. Tomēr klasiskā ģenētika ir mūsdienu ģenētikas pamats.